MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia tasmaniensis Et1/99 plasmid pET45

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010699	TAT	2	6	54	59	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010699	CAA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010699	CAAA	2	8	997	1004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010699	GTA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010699	AGC	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010699	TA	3	6	2660	2665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010699	CCT	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010699	CA	3	6	2706	2711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010699	AAC	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010699	AGA	2	6	2772	2777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010699	T	7	7	2785	2791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010699	GAAA	2	8	2798	2805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010699	A	8	8	2803	2810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010699	ATGA	2	8	2931	2938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010699	TAT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010699	T	7	7	3273	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010699	TAA	2	6	3356	3361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010699	A	7	7	3360	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010699	CTG	2	6	3800	3805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010699	CTG	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010699	GAA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010699	A	7	7	4533	4539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010699	ATT	2	6	4594	4599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010699	T	6	6	4663	4668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010699	CA	3	6	4714	4719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010699	AT	3	6	8642	8647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010699	T	6	6	13348	13353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010699	CTCG	2	8	22112	22119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010699	GCG	2	6	22148	22153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010699	CGG	2	6	32060	32065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010699	GCC	2	6	32099	32104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010699	ATTT	2	8	32251	32258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010699	GGC	2	6	32294	32299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010699	AAGC	2	8	32430	32437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010699	CAG	2	6	33373	33378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010699	TC	3	6	33395	33400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010699	TCT	2	6	33466	33471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010699	CCCG	2	8	33527	33534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_010699	ATT	2	6	33556	33561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010699	T	6	6	33590	33595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010699	TTA	2	6	33612	33617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010699	A	11	11	33638	33648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010699	GT	3	6	33717	33722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010699	AT	3	6	33833	33838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010699	GAA	2	6	33891	33896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010699	A	6	6	33895	33900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010699	TTA	2	6	33965	33970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010699	TA	3	6	34120	34125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010699	TGT	2	6	34252	34257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010699	A	7	7	34295	34301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010699	AAT	2	6	34925	34930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010699	CTT	2	6	34986	34991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010699	CTG	2	6	35006	35011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010699	GCA	2	6	35031	35036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010699	CTGT	2	8	35129	35136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010699	TA	3	6	35576	35581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010699	ATA	2	6	35632	35637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010699	A	6	6	35637	35642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010699	ACC	2	6	36032	36037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010699	TCC	2	6	36041	36046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010699	TGCC	2	8	36650	36657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010699	TCA	2	6	36669	36674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010699	TGC	2	6	36781	36786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010699	CAGA	2	8	36790	36797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010699	TGAA	2	8	36803	36810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010699	GTG	2	6	37319	37324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010699	TCA	2	6	37387	37392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010699	GT	3	6	37396	37401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010699	GAT	2	6	38948	38953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010699	AT	3	6	39008	39013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010699	T	6	6	39042	39047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010699	CAG	2	6	39058	39063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010699	TG	3	6	39110	39115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010699	AT	3	6	39127	39132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010699	ATT	2	6	39161	39166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010699	ATT	2	6	39215	39220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010699	T	6	6	39224	39229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010699	T	7	7	39260	39266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010699	TAA	2	6	39308	39313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010699	CTA	2	6	39323	39328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010699	TCAC	2	8	39374	39381	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010699	GCTC	2	8	40766	40773	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010699	CGC	2	6	41293	41298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010699	GCC	2	6	41300	41305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010699	TCA	2	6	41337	41342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010699	GCG	2	6	41376	41381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010699	GCG	2	6	41452	41457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010699	ATT	2	6	41500	41505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010699	GTT	2	6	41938	41943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010699	TAT	2	6	42138	42143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010699	CGC	2	6	42198	42203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010699	CTG	2	6	44281	44286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010699	C	6	6	44321	44326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_010699	C	7	7	44392	44398	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_010699	CAC	3	9	44468	44476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010699	TGA	2	6	44601	44606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010699	AGC	2	6	44621	44626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010699	AGGTCA	4	24	44641	44664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010699	GAT	3	9	44679	44687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.